Семинар: «Современные методы и подходы в молекулярно-генетических исследованиях систематики растений»

Томский государственный университет, Биологический институт, семинар: «Современные методы и подходы в молекулярно-генетических исследованиях систематики растений»

Сроки обучения: 10.03.14 – 15.03.14

Аудитория Дата Время  

 

Дисциплина

Преподаватель
223 ауд.

главный корпус

(Гербарий)

10.03.14

(понедельник)

14.00

 

14.45–16.20

 

 

 

16.35–18.10

 

 

 

 

 

Организационные вопросы

 

Геном растений и современные методы его идентификации.

(Лекция, 2 часа).

 

Возможности молекулярно-генетических методов для выяснения родственных отношений между видами, определение гибридов, филогенетические вопросы.

(Лекция, 2 часа).

А.А. Кузнецов

 

Н.В. Фризен

223 ауд.

главный корпус

(Гербарий)

11.03.14

(вторник)

10.35–12.10

 

 

 

 

 

12.25–14.00

 

 

 

Молекулярные методы исследования ДНК растений, базирующиеся на анонимном полиморфизме ДНК: (RAPD, AFLP.SCAR.SCoT, CAPS, ISSR; SSR).

(Лекция, 2 часа).

 

ДНК-таксономия и современные методы изучения последовательностей ДНК: секвенирование.

(Лекция, 2 часа).

Н.В. Фризен
223 ауд.

главный корпус

(Гербарий)

 

 

 

016 ауд.

главный корпус

(цокольный этаж)

12.03.14

(среда)

10.35–12.10

 

 

 

 

 

12.25–16.20

Методы филогенетического анализа: процедура выравнивания (Alignment), филогенетические деревья и методы их построения.

(Лекция, 2 часа).

 

Выделение ДНК из растений и проверка качества выделения.

(Практическое занятие, 4 часа).

Н.В. Фризен
016 ауд.

главный корпус

(цокольный этаж)

13.03.14

(четверг)

08.45–14.00

 

 

 

 

14.45–20.00

Методы ISSR (InterSimpleSequenceRepeat) иSCoT (Start Codon Targeted Polymorphsm).

(Практическое занятие, 6 часов).

 

Методы ISSR (InterSimpleSequenceRepeat)иSCoT (Start Codon Targeted Polymorphsm).

(Практическое занятие, 6 часов).

Н.В. Фризен
016 ауд.

главный корпус

(цокольный этаж)

14.03.14

(пятница)

08.45–14.00 Амплификация фрагментов хлоропластной и ядерной ДНК.

(Практическое занятие, 6 часов).

 

Н.В. Фризен
322 ауд.

главный корпус

(компьютерный класс)

15.03.14

(суббота)

08.45–14.00

 

 

 

 

 

14.45–18.10

 

 

18.25–20.00

Использование фрагментов хлоропластной и ядерной ДНК для реконструкции филогении; работа с Базами Данных (Генетические Банки) и с программами анализа ДНК.

(Практическое занятие, 6 часов).

 

Построение деревьев и их анализ.

(Практическое занятие, 6 часов).

 

Итоговая аттестация.

Н.В. Фризен
Материалы

Презентации

Лекция 1 Геном растений и современные методы его идентификации
Лекция 2 Возможности молекулярно-генетических методов для выяснения родственных отношений между видами, определение гибридов
Лекция 3 Молекулярные методы ДНК анонимный полиморфизм
Лекция 4 ДНК таксономия и современные методы изучения последовательностей ДНК
Лекция 5 Методы филогенетического анализа процедура выравнивания